杨婷婷^1,2 , 冯致¹ , 刘艳玲¹ , 杨果¹ , 李萌¹ , 王义强^1,2*

1 中南林业科技大学, 林业生物技术湖南省重点实验室, 长沙, 410004; 2 中南林业科技大学, 经济林培育与保护教育部重点实验室, 长沙, 410004
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2020年05月14日    接受日期: 2020年05月18日    发表日期: 2021年08月09日

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本研究筛选银杏三个年龄阶段开花调控的关键基因，揭示银杏开花调控年龄途径的分子机理，为促进银杏早花、分子育种和推广种植提供科学依据。本研究利用高通量测序技术及生物信息学工具，对三个年龄阶段的银杏雄花芽进行转录组测序，对测序数据进行分析，筛选出年龄途径关键差异表达基因。转录组测序转录组测序共产生 57.45 Gb 原始数据，注释到 8 大功能数据库(GO, COG, KEGG, KOG, NR, Pfam, SwissProt, eggNOG)上的 Unigene 总数为 35 058 个。通过 KEGG 通路注释和 GO 富集分析，将 Unigene 分别归于55 个 GO 类别和 126 个代谢途径。差异表达基因分析显示，幼年雄花芽较开花一年雄花芽有 37 个基因上调，75 个基因下调；幼年雄花芽较开花多年雄花芽有 592 个基因上调，871 个基因下调；开花一年雄花芽较开花多年雄花芽有 961 个基因上调，1 203 个基因下调。本研究发掘出大量的开花相关的基因，最终筛选出SPL (gene.Gb_23724, gene.Gb_03922)、AP2 (gene.Gb_00766)、MADS-box (gene.Gb_01886, gene.Gb_15398, gene.Gb_28337, Gingko_newGene_2213)、GA 调节蛋白(gene.Gb_34467, gene.Gb_28606, gene.Gb_33214)和 DELLAs蛋白(gene. Gb_34644)等 11 个年龄途径开花调控的关键基因。

银杏(Ginkgo biloba)；转录组测序；年龄途径；差异基因